Ha pasado un año desde la Rebelión Negra, un levantamiento fallido contra el Sacro Imperio Británico liderado por el vigilante enmascarado Cero, quien ahora está desaparecido. Perdidos sin su líder revolucionario, el grupo de resistencia del Área 11, los Caballeros Negros, se encuentran demasiado impotentes para combatir la brutalidad infligida a los Elevens por Britannia, que ha aumentado significativamente para aplastar cualquier esperanza de una futura revuelta. Lelouch Lamperouge, después de haber perdido todos los recuerdos de su doble vida, vive en paz junto a sus amigos como estudiante de secundaria en la Academia Ashford. Su antiguo compañero C.C., incapaz de aceptar este giro de los acontecimientos, se encarga de recordarle su propósito pasado, con la esperanza de que el autor intelectual Zero se levante una vez más para terminar lo que comenzó, en esta emocionante conclusión de la serie.
