El estudiante de secundaria Kaname Sudou recibe una invitación de un compañero de clase para jugar a Darwin's Game, un juego de móvil del que nunca ha oído hablar. Sin embargo, en cuanto abre la aplicación, una serpiente verde sale de repente de la pantalla de su teléfono y le muerde el cuello, dejándole inconsciente. Al despertarse en la enfermería sin signos de mordedura de serpiente, en el colegio le dicen que se tome el resto del día libre. Desconcertado por lo sucedido, descarta la experiencia surrealista como una alucinación y se sube al tren para volver a casa.
Desgraciadamente, su curiosidad le vence y vuelve a utilizar la aplicación. Como la aplicación parece ser como cualquier otro juego de batallas, Kaname respira aliviado y decide empezar su primera partida. Sin embargo, la agradable sorpresa le dura poco, ya que su oponente en el juego aparece inesperadamente justo delante de él e intenta darle caza con un cuchillo.
Mientras corre desesperadamente para salvar su vida, Kaname suma dos más dos y se da cuenta de que Darwin's Game no es un juego corriente, sino más bien una brutal lucha por la supervivencia.
