Aunque alegre y delicada, Sakura Sakurakouji es una hábil artista marcial con un sentido de la justicia que nunca flaquea, sin importar la situación. Al presenciar a las personas quemarse en llamas azules mientras viajaban en autobús a casa, llama a la policía para llevar a su asesino ante la justicia y descubre que no quedan pruebas. Sin embargo, todas sus dudas sobre lo que vio se desvanecen cuando al día siguiente, la nueva estudiante transferida Rei Oogami se une a su clase; él es el mismo chico al que vio cometer un asesinato a sangre fría.
Rei es amable, dulce y rápidamente se vuelve popular, contradiciendo las acusaciones de Sakura. Muy pronto, se entera de su verdadera naturaleza: un Code Breaker, o "uno que no existe". Para sorpresa de Sakura, Rei, armada con poderes misteriosos, busca exigir justicia de acuerdo con el principio de "ojo por ojo". Decidida a llevar a Rei por el camino correcto, Sakura se mantiene cerca de él con la esperanza de redimirlo de sus caminos antes de que otros resulten heridos.
